El ligamento
genético consiste en la segregación conjunta de variaciones genéticas de un
mismo cromosoma físicamente cercanas. Los estudios de ligamiento genético
aplicados al mapeo de loci responsables de enfermedades se basan en la
identificación de regiones cromosómicas concretas que se transmiten en familias
de la misma manera que el fenotipo patológico.
En caso de no
disponer de familias extensas se pueden utilizar parejas de hermanos para
realizar estudios de ligamiento genético. Por calcular el grado de ligamento entre
dos loci, como pueden ser un marcador polimórfico de posición conocida y el gen
responsable de una enfermedad, se aplica un test para calcular el valor de LOD score (logaritmo de probabilidades) que corresponde al logaritmo
del cociente entre la probabilidad de
que dos loci estén ligados a una determinada fracción de recombinación y la
probabilidad de que no lo estén. El umbral de significación para cribados
genómicos corresponde a un valor de LOD score de 3,3, mientras que el umbral de
exclusión corresponde a valores inferiores a -2. Por valores ³ 1,86 que no
llegan a ser significativos se habla de ligamento 'sugestivo'.
Hay dos métodos principales para el análisis de ligamiento genético: el paramétrico, en el que hay que asumir un determinado modelo de herencia, y el no paramétrico, en el que no se asume ningún tipo de herencia concreto. En los estudios de parejas de hermanos, este último método evalúa si parejas de afectados comparten más marcadores idénticos para descendencia (IBD), es decir heredados del mismo progenitor, lo que se esperaría por azar.
Hay dos métodos principales para el análisis de ligamiento genético: el paramétrico, en el que hay que asumir un determinado modelo de herencia, y el no paramétrico, en el que no se asume ningún tipo de herencia concreto. En los estudios de parejas de hermanos, este último método evalúa si parejas de afectados comparten más marcadores idénticos para descendencia (IBD), es decir heredados del mismo progenitor, lo que se esperaría por azar.
Los métodos no
paramétricos se pueden aplicar también a familias con un elevado número de
afectados. A menudo los métodos no paramétricos se consideran los más adecuados para el estudio de enfermedades complejas.